Республика Алтай является полноправным субъектом Российской Федерации.

Система государственной власти в Республике Алтай основана на принципах разделения законодательной, исполнительной и судебной властей, а также разграничения полномочий республиканских и местных органов власти.

Высшим должностным лицом в Республике Алтай является Глава Республики Алтай.

Высшим органом законодательной власти Республики Алтай является Государственное Собрание - Эл Курултай Республики Алтай - постоянно действующий орган представительной власти. Основная функция - подготовка и принятие законодательных актов по всем вопросам, отнесенным к компетенции Республики Алтай.

В Государственное Собрание (Эл - Курултай) избираются 41 депутат. Из числа депутатов образуются постоянные комиссии для ведения законотворческой работы, контроля за деятельностью государственных органов, предприятий, учреждений и организаций.

В период между сессиями Государственного Собрания его работу организует Президиум, возглавляемый Председателем Государственного Собрания.

Высшим исполнительным органом Республики Алтай является Правительство Республики Алтай, которое возглавляет Председатель Правительства Республики Алтай. Правительство Республики Алтай подотчетно Государственному Собранию.

В состав республики входят 10 районных муниципальных образований и столица - город Горно-Алтайск. В Республике Алтай существует вертикальная структура управления - в каждом районе и г. Горно-Алтайске управление осуществляют администрации муниципальных образований.